Dal 1985 è attiva a Damanhur la Scuola Familiare, nata dall'iniziativa dei genitori che desideravano seguire direttamente l'educazione dei figli, anche in ambito scolastico.

La Scuola damanhuriana copre le fasce di età dalla prima infanzia all'adolescenza fino alla terza Media e nasce in seno all'Associazione di Promozione Sociale "Damanhur Education" con l'ausilio di un gruppo di volontari ed il riferimento pubblico dell'Istituto Statale Comprensivo di zona. Secondo una visione olistica della conoscenza, la Scuola pone il bambino al centro del percorso educativo. Attualmente, sono 140 i genitori - compresi alcuni abitanti della Valle, non cittadini di Damanhur - che hanno scelto la Scuola damanhuriana, ritenendola all'avanguardia come processo educativo e formativo.

La Scuola Familiare ha dei principi fondanti che toccano la creatività espressiva, la sensibilità spirituale, la valorizzazione delle diversità, la cultura dell'ambiente e della pace attraverso il lavoro svolto con tutte le fasce di età.

Uno degli elementi fondamentali è l'itineranza, intesa come scuola che esce dalle aule e produce apprendimento e crescita attraverso l'esperienza pratica, viaggiando. I ragazzi, di tutte le fasce, compiono infatti frequenti esperienze in Italia e all'estero, commisurate alla loro età, acquisendo conoscenze e autonomia al di fuori del proprio ambiente abituale.

Ai programmi ministeriali italiani, la Scuola damanhuriana affianca anche attività legate all'espressione di sé, al contatto sensibile con la natura, alla sperimentazione costante di esperienze pratiche, che aiutino il ragazzo nello sviluppo armonico della propria personalità e ad apprendere dal vivo quanto sta imparando.

La Scuola Familiare di Damanhur accoglie bambini e ragazzi con età che vanno dai 6 mesi ai 14 anni, per un totale di circa 100 presenze; frequentano la scuola anche ragazzi francesi, inglesi e tedeschi e sono frequenti gli scambi con ospiti internazionali. L'insegnamento delle lingue straniere inizia con la fascia dei piccoli della scuola nido.

La Scuola partecipa attivamente a campagne di sensibilizzazione ambientale e di solidarietà. I ragazzi sono stati i protagonisti di alcuni incontri con Greenpeace, compresa l'ospitalità ricevuta sulla nave Rainbow Warrior, durante lo scalo a Genova dell'estate 2006, e sostengono la costruzione di una scuola nell'isola di Mancarroncito, in Nicaragua, attraverso l'Organizzazione Non Governativa Re.Te.

A fianco della Scuola Familiare, sono attivi l'Associazione Scout Damanhur, collegata a FederScout Italia, che conduce attività e viaggi per ragazzi dai 7 ai 15 anni e il gruppo "Temponauti"che opera nel campo dell'animazione e dell'educazione per giovani e adulti.